37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3611 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  284  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  53.44 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  52.34 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  50.38 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  49.64 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  50.78 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  50.78 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  46.46 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  44.53 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  40.31 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  36.72 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 303 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  37.14 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  35.34 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  32.03 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  33.82 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  32.54 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  37.59 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1307  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.556032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  32.12 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  30.37 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2772  PilT protein domain protein  28.07 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  29.77 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  27.48 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1369  PIN domain protein  29.01 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  30.22 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  27.48 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>