37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0595 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  55.22 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  53.03 
 
 		 148 aa  141  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  51.49 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  40.3 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  39.23 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  32.35 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  36.92 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  35.11 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  32.58 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  35.51 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  27.46 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  27.41 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  34.69 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  28.46 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  29.2 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  32.85 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  26.53 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  27.01 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  29.1 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  25.93 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1369  PIN domain protein  26.87 
 
 		 259 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  28.87 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  26.61 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  25.93 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  22.7 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  25.71 
 
 		 146 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  25 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  23.85 
 
 		 135 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>