33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1854 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  300  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  36.17 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  35.77 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  32.12 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  27.01 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  29.5 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  28.68 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  24.29 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  26.53 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  25.62 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  28.03 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  30.28 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  29.45 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  29.69 
 
 		 233 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  29.92 
 
 		 233 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  23.02 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  27.89 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  25.93 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  27.01 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  25.9 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  30.99 
 
 		 134 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5522  hypothetical protein  25.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  24.31 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  24.31 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  26.09 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  27.72 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  27.27 
 
 		 135 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>