13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5522 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5522  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  68.15 
 
 		 233 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  68.15 
 
 		 233 aa  188  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  37.16 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  35.46 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  32.84 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  27.94 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  29.41 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  32.12 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  21.01 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  29.93 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  25.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>