18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2149 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  100 
 
 		 136 aa  286  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  43.94 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2772  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1307  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.556032  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2551  PilT protein domain protein  28.15 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.959756  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0265  PilT protein domain protein  32.06 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  28.03 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  26.45 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1184  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.681973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  30.07 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  26.32 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  27.41 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  21.37 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  23.66 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  27.82 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  24.49 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  26.23 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02190  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  25.36 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.471212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>