18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0728 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  99.57 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5522  hypothetical protein  68.15 
 
 
145 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.435209  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5523  hypothetical protein  85.48 
 
 
101 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334018  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  43.07 
 
 
146 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  35.51 
 
 
149 aa  92.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 
146 aa  79  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  30.83 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1029  hypothetical protein  70.83 
 
 
81 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  32.84 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  31.85 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  33.83 
 
 
147 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  25.71 
 
 
143 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  31.96 
 
 
139 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  25.37 
 
 
142 aa  48.5  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  29.92 
 
 
145 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 
148 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  37.97 
 
 
135 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>