28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1030 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  37.68 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5522  hypothetical protein  37.16 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  35.51 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  36.3 
 
 		 233 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  27.41 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  35.56 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  26.12 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  32.37 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  34.51 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  27.27 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  28.37 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  27.01 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  30.5 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  29.9 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  27.94 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  23.02 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  30.65 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  24.82 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  30.94 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  28.78 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  28.78 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>