43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1631 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  306  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  32.62 
 
 
143 aa  94.4  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  33.09 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  33.1 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  27.82 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  29.17 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  27.01 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  35 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  32.17 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  30.88 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  27.54 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  34.81 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  30.37 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  36.69 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  31.43 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  35.07 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  30.99 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  30.99 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  29.01 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  27.41 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  33.81 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  31.34 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1369  PIN domain protein  33.58 
 
 
259 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  28.06 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  27.61 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5522  hypothetical protein  28.68 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.435209  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  28.28 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  35.66 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  26.76 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  32.37 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  26.87 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  28.47 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  27.74 
 
 
233 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  27.74 
 
 
233 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  34.29 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  28.99 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  23.42 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  23.02 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>