44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1400 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  100 
 
 		 145 aa  293  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  75.71 
 
 		 146 aa  227  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  51.49 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  41.91 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  43.28 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  40.6 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  39.26 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  36.17 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  32.35 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  33.83 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  31.11 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  34.85 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  30.83 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  30.83 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  27.82 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  28.36 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  28.57 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  37.38 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  32.65 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5522  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  32.61 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  26.12 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  28.36 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  27.94 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1572  hypothetical protein  88.89 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  28.36 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  29.73 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  26.67 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  28.87 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  29.93 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1369  PIN domain protein  29.58 
 
 		 259 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  25.76 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  28.57 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>