20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1166 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  54.1 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  43.65 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  40.5 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  37.38 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  37.38 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  38.68 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  28.44 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  37.96 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  33.03 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  30.65 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  37.97 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  37.97 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  26.45 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  31.3 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  34.35 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  23.42 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  23.85 
 
 		 138 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>