34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4271 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  284  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  64.12 
 
 		 137 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  53.12 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  54.69 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  52.71 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  49.23 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  46.62 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  46.62 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  44.53 
 
 		 135 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  42.31 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  36.15 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  33.09 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  34.38 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  33.1 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  32.09 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  25.93 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  34.09 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  34.31 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  31.78 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  28.87 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  32.84 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  30.99 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  27.89 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  31.88 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  28.03 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>