29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2491 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  54.74 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  46.48 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  43.65 
 
 		 135 aa  103  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  30.43 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  32.12 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  27.07 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  30.14 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  27.07 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  26.62 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  32.62 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  27.07 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  26.76 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  33.56 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  31.11 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1369  PIN domain protein  30.94 
 
 		 259 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  27.94 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  26.67 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  26.12 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  27.01 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  26.81 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  29.29 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  33.62 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  28.79 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 138 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  28.89 
 
 		 138 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>