38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1720 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  51.49 
 
 		 138 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  44.7 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  47.37 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  42.96 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  42.19 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  35.61 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  35.61 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  41.41 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  39.69 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  40.46 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  38.28 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  36.15 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  33.59 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  36.09 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  32.03 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  27.54 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  31.85 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  36.11 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  32.89 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  28.57 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  28.89 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  24.29 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  25.95 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  22.38 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  21.74 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  26.62 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  25.36 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  26.87 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  24.48 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  24.82 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1609  PilT domain-containing protein  37.25 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00219801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  23.88 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>