32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2930 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  100 
 
 
150 aa  301  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  64.08 
 
 
149 aa  192  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1369  PIN domain protein  66.2 
 
 
259 aa  185  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  42.76 
 
 
155 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  37.04 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  28.89 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  27.74 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  27.94 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  30.66 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  29.29 
 
 
147 aa  53.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  28.89 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  33.57 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  28.57 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  26.81 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  25.71 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  27.41 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  27.01 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  24.63 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  22.92 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  27.48 
 
 
135 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  29.1 
 
 
144 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  28.47 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  26.87 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  26.87 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  27.21 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  27.27 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  23.7 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  30.56 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  27.61 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  25.53 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>