23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0178 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  50 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  39.86 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  39.04 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  35.25 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  39.1 
 
 		 148 aa  87  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  33.08 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3531  PilT protein-like  37.14 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  39.55 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  34.09 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  33.79 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  30.66 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  33.81 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  30.15 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  29.85 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  42.86 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  27.41 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>