68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2164 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1154  MarR family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  41.5 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  40.38 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  24.36 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  25.44 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  24.04 
 
 		 160 aa  48.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  22.12 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  22.12 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  23.19 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  27.06 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  21.99 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 180 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  22.12 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 157 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>