More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3581 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  96.2 
 
 		 158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  96.2 
 
 		 158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  88.61 
 
 		 158 aa  270  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  64.47 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  61.81 
 
 		 158 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  38.51 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 180 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  26.52 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.36 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  29.05 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.36 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  29.31 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  30.99 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.72 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>