More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1659 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  307  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  54.81 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  57.35 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  58.73 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  40.27 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 161 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  37 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.16 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  37.37 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  35.51 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31.06 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.65 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>