More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3671 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  275  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  96.4 
 
 		 140 aa  244  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 174 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 180 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  50.37 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 160 aa  93.2  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 315 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  35.04 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.82 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.72 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  41.35 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>