285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1353 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  57.43 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 185 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 190 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  41.5 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  40.54 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 175 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 172 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 161 aa  90.5  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  34.07 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.85 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  30.77 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.68 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>