More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4858 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  36.43 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.17 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 158 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  34.65 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  31.06 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  31.06 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  31.06 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  31.06 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  31.06 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 315 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 158 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.64 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  29.25 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>