More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6384 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  43.7 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  39.44 
 
 		 177 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  32.8 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  32 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  32 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  32 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  32 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  34.96 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  31.94 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 188 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  32.58 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  31.31 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  28.57 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>