More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3027 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  338  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 193 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  33.77 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  36.17 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  34.97 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  33.33 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.08 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  31.75 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  32.67 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.97 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  33.01 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.27 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 189 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  32.89 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  26.26 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  36.49 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  36.49 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>