More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2197 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  338  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 303 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  43.18 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 315 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 148 aa  94  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  32.81 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  37.5 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.58 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  29.79 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.11 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 195 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  34.38 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  36.72 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  36.84 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>