More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2945 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  322  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  91.98 
 
 		 162 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  70.81 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  81.02 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  80.29 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  68.83 
 
 		 161 aa  211  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  36.42 
 
 		 172 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.33 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  35.56 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  36.09 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.36 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.96 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  30 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.08 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.23 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  36.99 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  30.53 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  32.47 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 296 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>