More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0807 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 151 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 151 aa  184  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 155 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  51.23 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  38.06 
 
 		 162 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  36.77 
 
 		 161 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 162 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  37.65 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  36.36 
 
 		 156 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 156 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 		 172 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  37.12 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.08 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  34.78 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  41 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  30.37 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  29.56 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  27.39 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  25.52 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.82 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.25 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.25 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 145 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  30.47 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 159 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 143 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 138 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 158 aa  52  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 138 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 147 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>