More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0284 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  57.46 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  56.3 
 
 		 162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  56.3 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  54.14 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  38.51 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  84.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.88 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 184 aa  84  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  34.42 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.54 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  34.07 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  26.43 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  28.35 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  29.14 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.99 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.31 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.31 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.31 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>