More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3825 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  317  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  42.18 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  36.23 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.46 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.55 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.46 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.39 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2841  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  31.45 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.61 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.97 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  30.51 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  31.03 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  31.03 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.03 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>