More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1714 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
157 aa  305  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  51.7 
 
 
168 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4084  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0692551  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.31 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
172 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  34.31 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.03 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
303 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.12 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.05 
 
 
178 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  39.18 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
184 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
183 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1876  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.6 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  33.79 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.11 
 
 
287 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
204 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  34.92 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  33.79 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.48 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  31.75 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.48 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  32.38 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
201 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  24.11 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  38.02 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>