More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0289 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
158 aa  306  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
164 aa  84  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  41.22 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  40.17 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  44.21 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  41.75 
 
 
287 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3344  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  42.02 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  36.64 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
303 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1485  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252569  normal  0.356309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  37.72 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
195 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.04 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 
142 aa  61.6  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  39.64 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  38.39 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 
146 aa  60.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
161 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  37.76 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 
142 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  35.79 
 
 
292 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.04 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4084  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0692551  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  33.79 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  31.45 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.45 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  31.45 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>