More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3344 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3344  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
134 aa  260  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1485  transcriptional regulator, MarR family  56.14 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252569  normal  0.356309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  48.62 
 
 
158 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  38.78 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  38.6 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  36.36 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  43.3 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
303 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  42.35 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
205 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.27 
 
 
287 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  44.87 
 
 
186 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.78 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38.78 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  37.76 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
244 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  31.78 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  33.91 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  31.78 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.98 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
197 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
157 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
167 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
146 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 
140 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 
160 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
142 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 
162 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.76 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  34.74 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
167 aa  50.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  44.16 
 
 
199 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.91 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  34.04 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  33.68 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  33.68 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  33.68 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.35 
 
 
312 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.56 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>