215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2764 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  47.71 
 
 		 169 aa  128  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  49.41 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  40.25 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  45.89 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 		 144 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 143 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  37.67 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  42.16 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  41.41 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.3 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  38.46 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  36.96 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  39.81 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.33 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 149 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 135 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.59 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.25 
 
 		 151 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 149 aa  48.5  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  42 
 
 		 153 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  32.86 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.94 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  34.74 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  27.71 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  32.73 
 
 		 160 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 150 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 138 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  43.08 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 161 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 157 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>