More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3476 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  97.42 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  89.03 
 
 		 155 aa  277  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  87.66 
 
 		 155 aa  273  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  85.99 
 
 		 158 aa  266  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 155 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  61.74 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  65.49 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  58.39 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  58.11 
 
 		 148 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 156 aa  156  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  63.57 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  66.94 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  53.57 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  45.65 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 163 aa  93.6  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 134 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  38.46 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  39.36 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  37.04 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  32 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  30.53 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  30.53 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  30.53 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>