More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2225 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  317  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  79.87 
 
 		 159 aa  247  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  70.48 
 
 		 167 aa  227  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  49.36 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 175 aa  103  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  36.03 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  36.18 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 244 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  37.9 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.98 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32.98 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  33.08 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32.98 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  31.91 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  31.91 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.77 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.23 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  41.76 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  32.98 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  31.69 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  30.15 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  28.7 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.78 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.79 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>