More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1502 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  319  7e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  28.35 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  23.97 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  26.23 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.59 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.59 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.59 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.59 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.59 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.59 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.59 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  23.49 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>