More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2532 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 166 aa  336  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  42.04 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  34.46 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  46.53 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.58 
 
 		 287 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 199 aa  51.2  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  33.61 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  28.16 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  25.47 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 244 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  43.06 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  38.46 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  24.29 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  35.56 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 223 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  29.1 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  22.48 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>