More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0331 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 153 aa  190  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.36 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  25.16 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.47 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.09 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 138 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  32.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  35.48 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  35.21 
 
 		 287 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7125  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  26.89 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  30 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.19 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>