More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4116 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  98.66 
 
 
149 aa  295  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  52.11 
 
 
149 aa  153  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
145 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  45.27 
 
 
155 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
158 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  53.91 
 
 
156 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
137 aa  110  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  47.75 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
149 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 
148 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  41.48 
 
 
149 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
156 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
156 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
145 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  50.41 
 
 
172 aa  90.5  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
144 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  51.04 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  40.31 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  40 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
134 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  39.85 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  36.67 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  43.69 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  32.86 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  35.24 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
164 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>