More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2885 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 156 aa  248  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  76.97 
 
 		 153 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  77.48 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 145 aa  186  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  65.71 
 
 		 171 aa  183  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  66.43 
 
 		 148 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  67.14 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  66.43 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  66.43 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  68.24 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  65 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  61.86 
 
 		 139 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  55.22 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  45.52 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  47.46 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  40.52 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  37.23 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 144 aa  84  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  38.66 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  37.04 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  33.98 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.59 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  26.36 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>