More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4414 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
140 aa  289  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  94.29 
 
 
140 aa  276  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  76.43 
 
 
141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  67.18 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  65.65 
 
 
154 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
142 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  61.83 
 
 
142 aa  167  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  55.73 
 
 
147 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  52.71 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  52.71 
 
 
140 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  48.06 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  48.06 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  47.29 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  47.29 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
155 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  39.53 
 
 
164 aa  94  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
144 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
163 aa  84.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  37.21 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  31.82 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  31.3 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
179 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  35.66 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
170 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  32.06 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
315 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>