123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3544 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  337  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  36.19 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  38.14 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  33.88 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  29.1 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  25.52 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  27.41 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 136 aa  47.8  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 132 aa  47.4  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  39.13 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30.51 
 
 		 283 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  30.1 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 142 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 138 aa  43.9  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  27.43 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  29.63 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  29.63 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  27.17 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  21.79 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>