141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2343 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  289  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  90.91 
 
 
143 aa  268  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  90.91 
 
 
143 aa  268  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  93.01 
 
 
143 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  93.01 
 
 
143 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  93.01 
 
 
143 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  81.12 
 
 
143 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
142 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  48.06 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
138 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
141 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
140 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
142 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 
142 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 
151 aa  67  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
212 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  31.45 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  29.69 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  35.14 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  32.52 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 
149 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
179 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.67 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.67 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
184 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
170 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  31.58 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>