More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0803 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  49.28 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  52.99 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  49.26 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  49.26 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 151 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.11 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.25 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  45.21 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  46.62 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 171 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  49.62 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.62 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  44.96 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  43.8 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 149 aa  120  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 165 aa  120  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 185 aa  120  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  46.04 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 		 167 aa  119  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  46.28 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  46.28 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  43.18 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  39.58 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 170 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 150 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 267 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.42 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.42 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  47.73 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  41.78 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 153 aa  113  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  44.85 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>