More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0928 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  89.19 
 
 		 171 aa  269  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  77.03 
 
 		 149 aa  229  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  77.03 
 
 		 149 aa  229  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  75 
 
 		 150 aa  210  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 155 aa  183  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  66.43 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  65.47 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 172 aa  141  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  56.03 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  60.66 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  43.28 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  36.76 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  37.07 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  34.26 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  36.19 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  31.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  28.16 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>