268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16300 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
120 aa  227  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  67.23 
 
 
149 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  67.23 
 
 
137 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  63.79 
 
 
134 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  62.93 
 
 
134 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  62.93 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 
134 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  67.24 
 
 
134 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  59.48 
 
 
134 aa  105  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  49.56 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  60.76 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  59.04 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
132 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  60.53 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  41.96 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
168 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
171 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  35.19 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  37.61 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  33.61 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  35.51 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  26.72 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  37.89 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
172 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
175 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
212 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>