125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3996 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  100 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 154 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 154 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  35.83 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  35.54 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  34.38 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  34.44 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  30.84 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  29.31 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  31.25 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  32.71 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>