207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3110 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 142 aa  275  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  95.07 
 
 		 142 aa  223  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  90.85 
 
 		 142 aa  216  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  48.46 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  54.37 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  41.98 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  43.86 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  41.74 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  40.62 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  35.77 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  37.1 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  32.2 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  32.2 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  34.07 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>