171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5487 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  90.91 
 
 		 143 aa  268  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  89.51 
 
 		 143 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  89.51 
 
 		 143 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  89.51 
 
 		 143 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  47.29 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  31.06 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  28.78 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  33.61 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  30.33 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.97 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.97 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>