More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3484 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  302  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  81.88 
 
 
149 aa  254  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  81.88 
 
 
149 aa  254  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  74.67 
 
 
171 aa  228  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  75 
 
 
148 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  64 
 
 
155 aa  189  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  64.19 
 
 
155 aa  189  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  64.19 
 
 
155 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  66.2 
 
 
158 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  63.89 
 
 
145 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  63.09 
 
 
155 aa  186  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 
148 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  65.94 
 
 
146 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 
155 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  69.93 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  66.22 
 
 
153 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
156 aa  160  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  60.81 
 
 
148 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
154 aa  146  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
154 aa  146  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  60.48 
 
 
145 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  62.16 
 
 
172 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  53.19 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  59.35 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  42.22 
 
 
149 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  47.46 
 
 
149 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 
156 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  37.23 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
175 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
212 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  29 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  30.56 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  32.2 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>