More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2670 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 156 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  33.33 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  35.24 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  32.46 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.97 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.97 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.97 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.97 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.97 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.97 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  41.53 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  32.04 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 171 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  29.31 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  38.6 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>